BT’X est avant tout l’histoire de deux frères : Teppei et Kotaro. Kotaro est un éminent scientifique, Teppei est quand à lui un homme d’action au grand coeur. La vie de ces deux orphelins aurait put suivre un cours normal, mais c’était sans compter sur la Mecanicae Imperium dont le dessin est d’imposer ses concepts aux monde entier grâce à son avance technologique. Cet empire va enlever Kotaro, qui pourrait s’avérer un allié précieux pour leurs plans de conquête. Teppei se lance à son secours, bientôt aidé par un BT’, un robot intelligent à la forme de cheval ailé puis par Lon et Fhou qui se rebellent contre la tyrannie de l’empire mécanique...